非淋感染久治不愈的原因一般有：
1、第一次的治疗不彻底。患者通常是没有自觉症状，认为已治愈，所以擅自停药或省去到医院复查的麻烦。
2、患者治愈心切。他（她）大都会查资料，而去药房买一些相关的药，等到症状总是不能缓解的时候，才想到去医院看病。可是正是由于患者的私自用药，而导致病原体对很多药物产生了耐受，部分女性患者由于过分清洗阴道而出现菌群失调，二重感染，给治愈带来困难。
3、性伴侣未同时治疗。我们都知道非淋感染是一种以性接触传播为主的疾病，但如果仅仅一方治疗，还是还容易重复感染的。
5、未认真执行医嘱。如个人卫生，与他人隔离未做好；烟酒、刺激性辛辣食物不忌口。