生殖器疱疹病毒与生殖器恶性肿瘤关系密切。生殖器疱疹的Ⅱ型疱疹病毒可能是宫颈癌的潜在致癌因子。近十多年来，已发现宫颈癌和性活跃有关，而Ⅱ型疱疹病毒又是性活跃人群中常见的致病因子，宫颈又常是病毒的复制部位，并且发现生殖器疱疹常常与宫颈癌并发。患过生殖器疱疹的妇女比未患过者得宫颈癌的危险性大5-10倍。
近来，在宫颈癌组织、剥脱细胞或癌前期细胞中发现了Ⅱ型疱疹病毒特异抗原。从而表明Ⅱ型疱疹病毒在宫颈癌的发生过程中起了重要作用。另外，从阴茎癌病人的活检材料中也观察到单纯疱疹病毒样颗粒。因此把感染HSV患者视为癌变的高危人群，这部分人群定期做相关的检查以便早期发现癌变预兆是十分必要的。
感染HSV的妇女相对于正常人来说增加了宫颈癌变的可能性，因此反复发生生殖器疱疹的妇女应定期做妇科检查，特别是要做宫颈涂片检查，以便及时发现宫颈癌。
虽然不是每一个生殖器疱疹病人都会演变成癌，但是一旦患生殖器疱疹，就要做到早发现早治疗，选择正规医院，彻底治愈。