男性淋病：急性期的最早症状为尿道口红肿、发痒及轻微肿痛，继而有稀薄粘液流出，引起排尿不适。24小时后症状加剧，红肿发展到整个阴茎头及部分尿道，分泌物由稀薄转为深黄色的脓液，出现尿频、尿痛、排尿困难、行动不便，阴茎常有痛性勃起。少数病例有微热及疲乏症状。两侧腹股沟淋巴结可红肿疼痛，甚至化脓。
一周后，症状可逐渐减轻，阴茎头和尿道口红肿消退，分泌物变为稀薄粘液或消失。一个月后症状可完全消失，但是晨间尿道口尚有微量粘液或尿道口被粘着。
淋病在一定条件下会长期存在，成为慢性淋病，侵入深层腺体后，可能潜伏于疤痕组织中。
女性淋病：症状不十分明显，淋球菌主要侵犯的部位是尿道和宫颈。感染淋病后3～14天出现症状，急性淋病主要表现为尿道口发痒、刺痛、红肿、有大量稀薄粘液和脓性分泌物，并可有尿频、尿急、排尿困难等，也可出现阴痛刺痒，分泌物增多，呈稀薄粘液状或黄色粘稠脓液样。检查可见阴道壁红肿，宫颈充血糜烂等。
慢性淋病可见尿道或阴道内病变处肉芽组织增生、息肉样变，甚至可见疤痕形成所致的尿道狭窄等。