妊娠期用药有可能影响胎儿的正常发育，这一点目前已引起人们的高度重视，但也不可谈药色变，得了病硬扛着不治，尤其是感染性疾病，这样对孕妇及胎儿都不利。其实妊娠期只要正确选用抗生素，是能做到既能治疗孕妇疾病又不影响胎儿健康的。
目前已有足够的证据证明，青霉素类(如青霉素、氨苄西林、阿莫西林、氧哌嗪青霉素、美洛西林等)及头孢菌素类(如头孢氨苄、头孢唑啉、头孢拉定等)抗生素对胎儿是安全的。以上两类药物都能抑制细菌细胞壁合成而起到杀菌作用，人的细胞没有细胞壁，故药物的毒性低，可安全用于妊娠各期感染患者。大环内酯类(如红霉素、白霉素、林可霉素、严迪、罗红霉素等)毒性也小，也可用于孕妇。
氨基甙类抗生素(如庆大霉素、卡那霉素、丁胺卡那霉素、妥布霉素等)对胎儿听力及肾脏有损害。四环素类抗生素(如四环素、土霉素、强力霉素、甲烯土霉素等)容易经胎盘进入胎儿体内，孕早期可致胎儿畸形，四肢发育不良及小肢畸形，孕中期可致牙蕾发育不良，从而使乳牙呈棕黄色及牙釉质发育不良，恒牙发育也受影响，易造成龋齿，孕后期可引起肝、肾损害。喹诺酮类(如吡哌酸、氟哌酸、氟啶酸、氟嗪酸等)在动物实验中可引起幼崽儿关节发育受损，虽然在人尚无这方面的证据，应用时也应谨慎。磺胺类(磺胺甲基异恶唑等)，容易通过胎盘进入胎儿体内，与血浆蛋白结合，而将胆红素替换出来导致新生儿黄疸。甲硝唑类药物容易通过胎盘进入胎儿体内，动物实验有致畸作用，尤其是妊娠头3个月，组织器官形成时期更是危险，故不宜应用。
总之，妊娠期患了感染性疾病既不可以硬扛着不治，也不可盲目滥用药物，要及时到医院在医生指导下合理选用药物进行治疗。