生殖器疱疹的传染源：人是单纯疱疹病毒的唯一自然宿主。主要传播途径是与生殖器疱疹患者发生性接触，但有疱疹史而无症状的带菌者也是传染源。发作期、恢复期患者，以及不显症状的所谓健康带菌者为本病的传染源。主要通过病损处的水疱疱液、唾液及粪便中存在的病毒进行传播。本病主要通过性行为传染，通过被污染物品的间接传染较少。此外，患生殖器疱疹的母亲，在分娩过程中，经过产道可将病毒直接传染给新生儿，或怀孕过程中患病，当机体抵抗力低时，病毒可通过胎盘传给胎儿。某些因素如情绪激动、发热、月经来潮、性行为等，使潜伏于神经节内的病毒活化后沿周围神经下行至表皮细胞引起局部病损。
本病传染性极强，凡与患有阴茎疱疹的男性发生一次性接触的女性，约有60-80%可受感染。本病危害性严重，复发率高，目前无特效治疗方法，尚可引起女性不孕，流产或新生儿死亡。目前，许多学者还认为子宫颈癌和阴茎癌的发病与生殖器疱疹病毒感染有密切关系，因而引起人们极大的重视。