尖锐湿疣的早期阶段可无任何症状，继之出现外阴部瘙痒不适，分泌物增加，如伴有感染、坏死时则出现疼痛或出血。早期阶段患者自述皮肤、粘膜干燥不平，如病灶继续增大则可触及结节或肿块。好发部位在小阴唇内侧，大小阴唇间沟，会阴和肛周。病灶呈毛刺状、菜花状、鸡冠状的灰白色肿物。
病理检查是诊断尖锐湿疣的重要手段之一。主要病理特征为表皮角化过度，棘细胞层增生，在棘层中、上部可见到诊断性挖空细胞，多集中在棘层中、上部，呈灶性出现。诊断性挖空细胞是指细胞核出现异型性改变的挖空细胞。非HPV感染时，如其它炎症感染或正常女性生殖道上皮富含糖原的细胞退变时也可形成挖空细胞，但这些挖空细胞的出现，不足以诊断为尖锐湿疣。
核酸杂交及聚合酶链反应（PCR）是近年来发展起来的分子生物学检测手段。特别是PCR技术，可在短时间内使极微量的核酸片段扩增到数百万个特异DNA序列拷贝具有特异性强、灵敏度高、简便快速等优点。
阴道镜检查是诊断尖锐湿疣的一个简便、实用的方法，特别在尖锐湿疣的早期阶段，肉眼观察极易和假性湿疣混淆，造成误诊。阴道镜检查可以帮助将二者区别开来.