精液在生殖道内是以液体状态存在的。当精液从阴茎口射出后，立即变成胶冻状或凝结块样乳白色物质，此时精子包含在精液内部或附于表面，无法自由游动，５－４５分钟之后，精液产生一种自动液化过程使凝胶液化，变为稀薄流动的液体。这种凝集一液化过程都是酶催化的过程。精囊腺分泌的一种蛋白质样物质构成了形成凝胶样物质的基质，而前列腺分泌的一种纤维蛋白水解酶参与了液化过程，这种酶还可以溶解自凝块。有人已从精液中分离出一种分子量为３３０００的液化因子。
精液的这种液体一凝集一液化过程具有一定的生理意义。开始时呈液态是便于精液的射出。随后形成凝块有利于精液在阴道里停留较长时间，并使精子得到充分休息和获能。一旦液化，精子就有足够的能量穿透宫颈粘液，并向生殖道深处继续挺进，最终到达输卵管。在啮齿类动物，如大鼠具有凝固腺，精液射出时立即凝结形成一个阴道栓。完全把精液封死在阴道内，第二天阴道栓才会自行脱落。
当前列腺或精囊腺发生炎症时，由于蛋白水解酶的分泌缺乏或破坏，造成酶系统的失调，使得一些患者的精液放置１小时也不液化，或者液化不全，粘稠度太高。这就称之为精液不液化，是一种病理现象。在这种情况下，精子无法移行，自然会造成不育。因此，精囊腺和前列腺疾病是引起不液化的重要原因。